佐渡トキ保護センターは、トキの保護増殖に取り組むための施設として、環境省が新潟県佐渡郡新穂村(現佐渡市)に開設した施設。1967年開設後、1993年 に現位置に移転。環境省が各地に設置している「野生生物保護センター」のひとつ。トキの増殖事業の他、保護増殖に必要な資料の収集、中国の研究者との共同研究などを実施している。